公務員中副主任科員與科員的待遇差別為一個級別。 公務員實行國家統(tǒng)一的職務與級別相結合的工資制度。公務員中副主任科員與科員都屬于非領導職務。
主任科員享受主任待遇，但無多大權利，歸科長領導。副主任科員享受副主任待遇，無權利，歸科長領導。
科員，副主任科員，主任科員的區(qū)別：
1、在性質上存在著不同：副主任科員和主任科員是副科級和正科級的非領導職務，這兩個是有一定級別的科員，而科員是指尚無職務的公務員。
2、在序列上不同：公務員的職級分兩個序列，一個是領導職務序列，一個是非領導職務序列。領導職務序列科員、副科、正科、副處等組成，非領導職務由科員、副主任科員、主任科員、副調研員等組成。
3、在實際的權利上不同：主任科員和副主任科員在層次上分別等同于正科職和副科職區(qū)別在于前者是非領導 只享受待遇；后者是實際在職位上 擁有實權；科員僅僅是科里不領導的成員，實際所擁有的權利很少;
1.三者同樣是科員職務，但級別不同。主任科員最高，副主任科員其次，科員第三。
2.副主任科員以下包括科員和辦事員。
3.職務提升由科員向副主任科員再向主任科員，當然較大重大突出貢獻的可以越級提升。其工資福利保險待遇逐級有所提升，幅度不大。
副主任科員應具備中專、高中以上文化程度。 副科級是“領導職務”，是所在單位（部門）的領導成員；副主任科員是“非領導職務”，雖然相當于副科級，但它不是單位（部門）的領導成員。 舉個例子：一個地級市的某某局，比如教育局，它是處級單位，局長是正處級，局里面的科，比如人事科，科長就是正科級，副科長就是副科級，科里面的普通工作人員，一般就是科員，根據(jù)資歷或表現(xiàn)，科員可以晉升為副主任科員，它在某些方面可以相當于副科級，但并不是副科長；同理，副主任科員可以晉升為主任科員，“相當于”正科級，但也并不是正科長?？崎L、副科長是這個科室的“領導”，而主任科員、副主任科員并不是領導。 還有，現(xiàn)在機關公務員改革有一個名詞叫作“改非”，就是領導干部到達一定年齡后（還沒退休），離開領導崗位，擔任“非領導職務”，比如原來的科長（正科級），不再擔任科長，保留級別，就變成“主任科員”了。
1、在系統(tǒng)內享受副主任科員工資待遇，下一步能晉升到主任科員職級。
2、綜合管理類的非領導職務分為：巡視員、副巡視員、調研員、副調研員、主任科員、副主任科員、科員、辦事員。
3、公務員的級別根據(jù)所任職務及其德才表現(xiàn)、工作實績和資歷確定。公務員在同一職務上，可以按照國家規(guī)定晉升級別。
公務員在職取得研究生學歷后是不能享受副主任科員待遇的，因為有了學歷后不能因為學歷而享受副主任科員的待遇，副主任科員是行政職務，同學歷沒有關系。
副主任科員相當于事業(yè)編的助理級職稱。行政系統(tǒng)職級與事業(yè)單位職稱大致對照：辦事員----員級職稱副科級----助理級職稱正科級----中級職稱副處級----副高級職稱正處級----正高級職稱副主任科員是中國公務員職務的一種，屬于綜合管理類非領導職務序列，級別相當于領導職務的副科長（副鄉(xiāng)長、副鎮(zhèn)長）。提升主任科員，需要任副科級職務三年以上。公務員職務分為領導職務和非領導職務。領導職務層次分為：國家級正職、國家級副職、省部級正職、省部級副職、廳局級正職、廳局級副職、縣處級正職、縣處級副職、鄉(xiāng)科級正職、鄉(xiāng)科級副職。
非領導職務分為：巡視員、副巡視員、調研員、副調研員、主任科員、副主任科員、科員、辦事員。
副主任科員是公務員和參公人員中，比科員高一等級，工作年限較長，在無編制崗位，無法任命副科級實職（如縣級部門中的副部長、副局長）而設置的虛職。
按照職級并行的政策，在科員崗位上工作若干年，就可以晉升為副主任科員；在副主任科員崗位工作若干年，又可以晉升為正主任科員。副主任科員的工資待遇接近副科級。
任職三年就可以轉，這只是規(guī)定而已，并不是說你三年以后必是主任科員。副主任科員升主任科員，需在副主任科員崗位任職滿3年以上，連續(xù)兩年考核評定為優(yōu)秀等次的，任職滿現(xiàn)年就可以晉升。這是必要條件，卻不是必須條件。
